ゲームは「更新フェイズ」「軍備フェイズ」「政略フェイズ」「作戦フェイズ」「合戦フェイズ」の5つのフェイズで進行していき、この一連の流れが終了すると1ターンが経過します。1ターンは季節に相当し、このターンを繰り返していくことでゲームは進みます。

新たな武将の登用や、秋の豊作、災害、飢饉などの様々なイベントが発生します。また、シナリオの進行にあわせたイベントが起きることもあります。

武将への俸禄や、兵や鉄砲の割り振りといった部隊の増強などを行います。

治水開墾や楽市楽座といった内政で国力を高めます。また、お気に入りの武将に会いに行くこともできます。今作の「会いに行く」コマンドでは自己鍛錬として天城颯馬を選択することが可能で、颯馬自身も成長させ易くなっています。

合戦の準備です。どの武将でどの城を攻めるか、作戦をたてます。

合戦には野戦と攻城戦の２種類があります。プレイヤーだけでなく、全ての勢力が独自の判断で戦いを仕掛け、全国で合戦が繰り広げられます。